А чем GnuPlot лучше например Excel'я?

Вот отличный вопрос, изложу своё мнение.
1) Сначала чем хуже.
- Для построение графиков надо установить gnuplot  и освоить работу с ним. Программа управляется с помощью специальных команд в диалоговом режиме, либо команды можно записать в файл заставить программу его выполнить. Освоить команды довольно долго, это сродни программированию. Поэтому построить простой график значительно дольше чем в Excel или OpenOffice
- строить круговые диаграммы тяжело.
2) В чем преимущества.
- преимущества как обычно тесно связаны с недостатками. Т.к. все управляющие команды записаны в файл (записаны вами или кто-то ещё составил этот файл) то чтобы построить график надо только запустить программу с эти файлом:

$gnuplot "fig1.plt"

Поэтому если приходится регулярно строить графики примерно одинаковые, как например характеристики слухового аппарата, то это очень удобно. Потратив время один раз, после можно строить десятки и сотни графиков по разным входным данным без усилий.
- можно очень гибко настраивать оси, сетку, надписи и т.п.
- графики можно получать во множестве форматов: png, jpg, векторной графики, специальных файлов ps (их можно сразу посылать на принтер для печати), просто изображения на мониторе;
- возможности очень широкие: 3D графики, анимация, градиенты и т.п.
Я пока не очень освоил эти возможности, но буду делать и выкладывать.